檀香是一味重要的中药材，历来为医家所重视，谓之"辛，温；归脾、胃、心、肺经；行心温中，开胃止痛"。外敷可以消炎去肿，滋润肌肤；熏烧可杀菌消毒，驱瘟辟疫。能治疗喉咙痛、粉刺、抗感染、抗气喘。有调理敏感肤质，防止肌肤老化的功效。去邪、去燥、杀菌、防霉、防虫、防蛀。具有安抚神经，辅助冥思、提神静心之功效。从檀香木中提取的檀香油在医药上也有广泛的用途，具有清凉、收敛、强心、滋补、润滑皮肤等多重功效，可用来治疗胆汁病，膀胱炎、淋病以及腹痛、发热、呕吐等病症，对龟裂、富贵手、黑斑、蚊虫咬伤等症特别有效，古来就是对治皮肤病的重要药品。